Сам спросил, сам ответил. Нашёл своё решение 4-х летней давности, но оно работает. Смотрим через "Настройки-внешний вид-стиль" название выбранной темы и что тема поддерживает gtk3. Идём в папку /usr/share/themes/"выбранная тема"
Открываем папку gtk3 как root (вводим пароль)
Открываем файл gtk.css (текстовым редактором) и добавляем две строчки
XfdesktopIconView.view .label { color: #000000; }
и
XfdesktopIconView.view .label:active { color: #000000; }
сохранем файл
и после перезапуска рабочего стола шрифты подписей иконок стали чёрными